bioRxiv: 新冠病毒新基因型与受体结合力可能提高上百倍

020年3月17日，南方综合大学张其威讲师，岭南大学张弓讲师共同通讯在bioRxiv上因特网发表题为“RBD mutations from circulating SARS-CoV-2 strains enhance the structure stability and infectivity of the spike protein”的数据库分析期刊，数据库分析发掘出SARS-CoV-2的RBD性状增强了刺突蛋白的结构准确度，其中的三种病原性状株与ACE-2受体的联结能力增强了100倍，预计性状病原株的病毒感染力和的传播力将牵涉到极大的增强。

数据库分析团队分析了世界性范围内的RBD性状，发掘出在的传播过程中的处于高正选择负荷下的10个基因；武昌，广州，香港和德国消失的三个RBD基因的恒定强酸系数（KD）比Wuhan-Hu-1病原低两个尺度，这是因为RBD的β-折叠支架稳定了；同时表明性状的病原已经进化，并且获得更加相比的病毒感染力。5个德国受控株和1个香港受控株具有不同的RBD性状，可增强联结依赖性，表明它们显然追溯到新的亚谱系。红眼和黑熊类SARS的冠状病原RBD的KD值由此可知这种红眼类SARS的冠状病原无法或不显然病毒感染人类；然而，黑熊冠状病原才会病毒感染人类。毕竟是在选择负荷下，对RBD这两项性状的分析进一步更深了我们对SARS-CoV-2小分子进化的认识。SARS-CoV-2与其宿主受体ACE-2联结依赖性的提高，在持续的COVID-19大流行期间，如果未采取有效的预防性，将存在更高病毒感染效用而且病毒感染也将更为严重。

当然短文为了审核由RBD性状引起的功能改变，对SARS-CoV-2和RBD基因进行了小分子动力学模拟以审核其与人ACE-2的联结能力。与Wuhan-Hu-1病原相比，五分之四的RBD基因（R408I除外）的联结自由能降低。其中的三个（N354D和D364Y，V367F，W436R）性状株与人ACE-2的依赖性显着提高，这三个基因的DG皆为-200 kJ / mol，比WH-1病原低约25%。SARS-CoV-2 RBD的KD = 14.7 nM，这三个基因的恒定强酸系数（KD）对于N354D和D364Y双性状计算为0.12 nM，对于V367F性状为0.11 nM，对于W436R为0.13 nM，比WH-1病原低两个尺度，表明性状病原的病毒感染力显着提高。

目前为止新闻媒体的244个SARS-CoV-2序列中的，有10个新的性状牵涉到在RBD区域。这些性状来自武昌、广州、香港、加拿大和德国、印度。其中的9个与较晚新闻媒体的序列只有一个性状，而来自广州的Shenzhen-SZTH-004有两个性状。同时，数据库分析者发掘出基因V367F来自德国（三人）和香港（1人），显然已经有较广泛的的传播。

以上皆是计算机模拟数据库，显然还并不需要更多的实验数据库进行保持恒定，陆上胺基酸目前为止在研发S-RBD基因，同时也期待全面性感兴趣的数据库分析职员共同合作。

许多现代来历：Junxian Ou, et al. RBD mutations from circulating SARS-CoV-2 strains enhance the structure stability and infectivity of the spike protein. bioRxiv. Posted March 17, 2020.